首先，如果膜結構表面存在一定的積水的話要及時將積水清理干凈。因此膜材本身具有非常優異的可塑性，因此也不可避免的會受到外力的影響而產生一定變形，當遇到雨雪天氣的話表面的不平整現象就會導致它的排水措施出現一些問題。不然大量的積水就會造成膜結構表面的損壞。少量的積水有可能只是對膜材性能產生一定影響，但是雨水的積多會加重其表面的荷載，不及時將雨水清理掉就會導致嚴重的后果。如果碰上南方的梅雨季節或者冬季長期的雨雪天氣就更加要注意排除的及時性了。
其次，為了防止膜結構汽車棚出現雨水積存的問題要在平時就做好它表面的清掃工作。雖然膜材本身是帶有一定自潔性的，但是外界堆積的灰塵或者飄落的樹葉等雜物必須要經過人工的清除工作才可以進行。如果不能及時做好這個工作的話降落到膜面上的雨水就會受到這些障礙物的阻礙而無法及時排出，嚴重的時候還會堵塞膜結構的排水通道。再者膜結構汽車棚在施工的時候必須要做好的它的排水系統的設計方案。膜面積水除了會受到后期人們的維護工作的影響，很大程度上還是由它本身的質量決定的。因此在設計的時候必須要嚴格控制好這一因素。
